2016年6月16日,未来基因诊断高精尖创新中心拟购的“第三代单分子实时DNA测序仪”购置可行性论证会在勺园5乙楼305会议室召开,会议由实验室与设备管理部副部长刘克新教授主持。
拟购的“第三代单分子实时DNA测序仪”是一套具有单分子实时DNA测序的设备。该设备对基因组中的GC含量的组成不敏感,可以有效跨越高GC或高AT等序列,因此可以实现对基因组更完整的覆盖,有利于全基因组序列的拼接和结构性变异的发现。目前校内无同类型设备。专家组根据申请人目前正在开展单细胞测序技术的研究需要,认为准确的基因组测序和组装对于生物进化和变异至关重要,需要较长的测序读长以拼接出准确的contig(Mb数量级的)用以覆盖较长的结构性变异区(包括)或重复区域。拟购设备平均读长可以达到10kb以上,有利于全基因组序列的拼接和结构性变异的发现;建库和上机测序过程中无需PCR,可以实现对样本DNA的单分子测序,对基因组更完整的覆盖,在测序的同时利用DNA聚合酶的动力学信息,无需亚硫酸氢盐转化,测序同时直接测定甲基化和其他各种表观遗传修饰;数据准确度高。设备的购置将提高北京大学在功能基因组学及其相关的许多学科的研究能力。
“第三代单分子实时DNA测序仪”的购置由未来基因诊断高精尖创新中心谢晓亮教授申请购置,经费来源为“未来基因诊断高精尖创新中心”经费。上述仪器设备购置经费已落实,运行经费有保障,专家组一致同意通过“第三代单分子实时DNA测序仪”的可行性论证。设备购置后将用于服务校内外科研工作,预计年开放共享机时为1800小时左右。可行性论证专家组由清华大学生科院王建斌研究员,中科院遗传所焦雨铃研究员,北京大学生命科学院陆剑研究员、伊成器研究员,生物动态光学成像中心张泽民研究员组成。