2016年12月8日,北京大学-清华大学生命科学联合中心拟购的“高并行结构生物学数据处理平台(二期)”可行性论证会在静园一号院101会议室召开,会议由前沿交叉学院院长助理李宁主持。
高并行结构生物学数据处理平台由两台或多台计算机服务器或节点在一个群组内共同工作,其中的每个节点通常都拥有自己的资源(处理器、I/O、内存、操作系统、存储器),并对自己的用户集负责。该平台可以利用多个计算机进行并行计算从而获得很高的计算速度,并且可以减少单点故障数量,实现资源的高可用性。目前校内同类设备使用机时饱满,无法满足申请人的需求。专家组根据申请人所在单位正在开展结构生物学研究需要,认为拟购设备相对于传统的CPU芯片具有更高的并行度与向量化运算能力,更高的堆积密度(可做到每2U容纳4节点高达240个以上的核心),更低的能耗(平均每个节点低于400W),并可大幅度提升生物分子机器的结构研究能力。该设备的购置将对加速结构生物学的数据处理具有重要意义。
拟购设备由北京大学-清华大学生命科学联合中心欧阳颀院士申请,经费来源为“生命科学联合中心设备费”,设备购置经费已落实,且运行经费有保障,专家组一致同意通过“高并行结构生物学数据处理平台”的可行性论证。可行性论证专家组由中国农业大学网络中心李吉祥副教授,北京大学物理学院王宏利教授、李方廷副教授,计算中心孙爱东高级工程师,定量生物学中心裴剑锋特聘研究员组成。