2017年10月26日,生命学院拟购的“高性能计算集群”购置可行性论证会在勺园5乙楼305会议室举行,会议由实验室与设备管理部部长刘克新教授主持。
“高性能计算集群”是两台或多台计算机服务器或节点在一个群组内共同工作的计算机集群,集群中的每个节点通常都拥有自己的资源(处理器、I/O、内存、操作系统、存储器),并对自己的用户集负责。与单独工作的计算机相比,集群化操作可以利用多个计算机进行并行计算从而获得很高的计算速度,而且可以减少单点故障数量,实现资源的高可用性,已经广泛地应用于数学、物理、化学、生命、工学、信息、地空、环科等领域。目前校内同类设备使用率高,机时饱满。专家组根据申请人课题组研究需要,认为拟购设备具备高并行性、高通量的结构生物学数据处理能力,能够满足申请人开展结构生物学和相关数据处理和软件技术的研究需求,将大幅度提升具有重要生物意义的生物分子的结构研究效率。设备的购置将对北京大学生物物理学科研工作具有积极的推动作用。
专家组一致同意通过上述设备的可行性论证,设备的购置经费来源为“统筹支持一流大学与一流学科建设经费”,由生命学院高宁研究员申请。仪器设备购置经费已落实,运行经费有保障。设备购置后将用于对冷冻电镜的数据进行处理需,并进行大规模的并行计算,预计年使用机时8600小时左右。可行性论证专家组由清华大学生命科学学院李雪明研究员、信息化技术中心刘乃嘉高级工程师,北京农业大学网络中心李吉祥六级职员,北京大学物理学院雷奕安副教授、计算中心樊春高级工程师组成。