2011年12月21日,生物动态光学成像中心拟购的“新一代快速测序仪” 和“高性能生物信息计算集群”购置论证会在实验室与设备管理部会议室召开,会议由实验室与设备管理部副部长刘克新教授主持。
“新一代快速测序仪”由生物动态光学成像中心谢晓亮院士申请,经费来源为985三期。拟购置的新一代快速测序仪是现代生命科学研究的前沿仪器,对于北京大学生命科学的基础科研与医学应用研究均具有重要意义。Illumina MiSeq测序系统是Illumina公司于2011年2月推出的最新测序设备,该款仪器使用了Illumina现有的边合成边测序试剂,是在单个仪器上整合扩增、测序和数据分析的测序仪,有着革命性的便捷流程。MiSeq系统上产生的测序结果可以很好地预测高量HiSeq2000测序平台所带来的结果,降低了初期投入的成本,让MiSeq成为试行大规模研究或开展需要速度和准确性的独立实验的理想选择。从样品到数据,最快只要8小时即可完成。目前校内生命学院等有多台同类设备,但部分参数无法满足申请人的研究需求。
“高性能生物信息计算集群”由生物动态光学成像中心李瑞强研究员申请,经费来源为北大-清华生命科学联合中心经费。拟购置的高性能生物信息集群是是新一代快速测序仪的配套设备,为海量数据的处理和分析提供稳定而高效的资源保障。随着生物动态光学成像中心生物研究不断进展,原有的集群已经不足以支撑快速增长的生物信息数据计算与存储的需求,基于此中心决定进一步投入计算跟存储等硬件资源,以满足计算处理能力和存储容量扩展的需求。本次数据中心设备扩容和处理能力升级,实现计算处理能力新增3.575Tflops,同时进行存储容量升级扩容。
专家组根据申请人在开展高通量测序研究方面的需要,认为该两台设备是生物信息学和基因组学等研究的关键设备,一致同意通过“新一代快速测序仪”和“高性能生物信息计算集群”的可行性论证。设备购置后将在满足申请人课题组科研需要的同时对校内外开放使用。
“新一代快速测序仪”的可行性论证专家组由中科院动物所韩春生研究员,中科院北京基因组研究所蔡军研究员,北京大学生命学院孔道春教授、张博教授,工学院朱怀球副教授组成。“高性能生物信息计算集群”的可行性论证专家组由北京大学计算中心崔建高级工程师、宋式斌高级工程师,信息学院崔立农高级实验师、佟冬副教授,数学学院马珊高级工程师组成。