北京大学化学学院分子操作环境采购。
申请人申请购置的软件用于建造分子操作环境,为科研所需。此软件需具备以下功能:
(1)涵盖从小分子到大分子的模拟(共包含50多个功能模块:小分子\蛋白\核酸\多糖构建,分子构象搜索,分子力学和分子动力学模拟计算,分子表面属性特征计算,分子对接(共价对接、基于模板对接、蛋白-蛋白对接),分子描述符计算,二维和三维定量构效关系建模,药效团模型建模,自动药效团模型建模,基于指纹图谱\描述符\的数据库搜索,生物大分子建模,蛋白质同源模建,抗体建模,生物信息学,序列分析,结构生物学晶体结构分析,酶学数据库,激酶数据库,结构毒性预测,“蛋白-配体”相互作用分析,基于结构的药物设计,基于片段的药物设计,基于配体的药物设计等);
(2)支持科学矢量语言(SVL),并通过编写SVL开发新算法、新应用,软件后台源代码公开并可以优化代码,并且可以自定义界面添加新算法、新模块;
(3)包含基于口袋三维相似性的反向寻靶、饱和环构象搜索和配体-蛋白相互作用指纹图谱分析功能;
(4)提供GOLD/FlexX对接程序的相关接口,支持调用Gaussian 进行量化计算;
(5)支持所有主流的硬件架构和操作系统,包括:Windows, Linux, MacOS X,同时支持64位和32位系统,并且所有的视窗和操作在各种平台下表现一致;
(6)提供教学license,供多人同时使用。
经调研只有Chemical Computing Group公司的MOE产品同时具备以上功能,因此拟采用单一来源方式采购,由Chemical Computing Group公司承担。现将有关情况向潜在供应商征求意见。
征求意见期限从2016年8月1日至2016年8月7日止。
潜在采购供应商对公示内容有异议的,请于公示期满前两个工作日内以实名书面(包括联系人、地址、联系电话)形式将意见反馈至北京大学实验室与设备管理部。
地址:北京大学勺园5甲四楼409房间
联系人:张婷,西鹏
联系电话:010-62751411,010-62758587